Table 2

Averaged p values from testing the null of no difference between paired outcomes by different methods over M=2000 MC replicates

Sample size	Paired t-test	Signed-rank test	GLMM (Poisson)	GLMM (NB)	GEE	GEE (log-link)
Dispersion parameter
n=10	0.042	0.042	0.380	0.154	0.089	0.136
n=25	0.043	0.050	0.371	0.092	0.064	0.076
n=50	0.045	0.050	0.295	0.069	0.056	0.065
n=100	0.049	0.050	0.268	0.058	0.052	0.056
n=200	0.052	0.060	0.284	0.059	0.054	0.057
Dispersion parameter
n=10	0.046	0.035	0.068	0.054	0.094	0.101
n=25	0.051	0.050	0.054	0.051	0.065	0.070
n=50	0.051	0.046	0.059	0.058	0.059	0.062
n=100	0.046	0.040	0.054	0.05	0.051	0.052
n=200	0.046	0.049	0.050	0.049	0.047	0.049

GEE, generalised estimating equation; GLMM, generalised linear mixed-effects model; MC, Monte Carlo; NB, negative binomial.